当你的男朋友在分手后回复“祝我幸福，要比没有他的时候活的更好”时，这句话可以有多重解读，具体含义可能取决于你们的关系、分手的原因以及他个人的性格和感受。以下是一些可能的解释：

真心祝福：

他可能真心希望你能够找到属于自己的幸福，即使你们不再是恋人关系。他希望你能过上更好的生活，这表明他对你仍然有一定的关心和善意。

希望减少内疚：

说出这句话可能是为了减轻自己内心的内疚感。分手后，他可能觉得自己有某种责任，希望通过对你的祝福来弥补这种责任感。

和平分手：

这可能是一种和平分手的方式，他希望以一种体面和礼貌的方式结束这段关系，同时表达出对你未来幸福的祝愿。

放下过去：

他可能已经下定决心放下这段感情，并希望你能从这段关系中走出来，找到新的幸福。这种祝福可以看作是他对你未来的一种期许和尊重。

客套话：

有时候，人们在分手后说“祝你幸福”可能只是一种客套话，并不一定代表他们内心的真实感受。这种情况下，这句话可能只是他为了维持双方关系而说的。

综合来看，这句话最有可能表达的是他对你未来幸福的真心祝福，同时也可能包含了他希望减少内疚感和希望和平分手的意味。当然，具体含义还需要结合你们的具体情况和分手的背景来判断。如果你觉得有必要，可以和他进一步沟通，了解他真实的想法和感受。