周瑜失荆州的原因是多方面的，主要包括以下几点：

战略失误：

周瑜在赤壁之战后，虽然大败曹军，但在战略上存在失误。他未能及时占领荆州，给了刘备集团趁虚而入的机会。刘备在周瑜与曹仁交战之际，迅速占领了荆州数郡，使得东吴的北进计划成为泡影。

诸葛亮的智谋：

诸葛亮在赤壁之战后，通过一系列智谋和策略，成功地从周瑜手中夺取了荆州。诸葛亮先是与周瑜诈降，然后在关键时刻抢先占领荆州，使得周瑜虽然打了胜仗，却未能得到荆州。

东吴内部矛盾：

东吴内部在夺取荆州的问题上存在矛盾。周瑜多次向刘备讨要荆州，但未能成功，反而赔上了自己主公孙权的妹妹孙尚香，并且折损了大量士兵，最终还被诸葛亮气死。

曹操的残余势力：

曹操虽然败退许昌，但其残余势力仍在荆州据守，给周瑜的进攻带来了很大阻力。周瑜在几次与曹仁等将领交战后，未能彻底击败曹军，也未能成功占领荆州。

综上所述，周瑜失荆州的原因主要是战略失误、诸葛亮的智谋、东吴内部矛盾以及曹操的残余势力等多方面因素共同作用的结果。