医生不建议收锦旗的原因主要有以下几点：

增加患者经济负担

很多病人经济并不宽裕，制作锦旗需要一定费用，少则几十元，多则上百元，这无形中增加了患者的经济负担。

误导其他患者

赠送锦旗可能会给其他患者带来误导，使他们认为不送锦旗会导致医生不尽心尽力看病，从而形成一种“物化”医患关系，给患者增添心理负担。

医生的“甜蜜负担”

医生面对患者送的锦旗，不收怕冷了患者的心，但如果全都接收，又怕形成不好的风气，让患者误以为这是一种“鼓励”，从而失去送锦旗的意义。

避免利益冲突

在医疗反腐力度加大的背景下，医生收受患者钱物属于违法行为。虽然锦旗不是直接的钱物，但它可能被视为一种名誉上的奖励，存在潜在的利益冲突。

影响正常诊疗

收受锦旗可能会干扰医生的正常诊疗工作，使他们无法专注于患者的治疗。

社会评价的合理性

有医生认为，锦旗是患者对医生作出评价的一种载体，如果谢绝锦旗，也应该考虑为社会评价提供其他展示平台，并通过这种评价为医生计发绩效等福利。

综上所述，医生不建议收锦旗主要是出于减轻患者经济负担、避免误导其他患者、减少自身负担、遵守法律法规以及保证诊疗质量等多方面的考虑。