三年级日积月累里的九个寓言故事包括：

杞人忧天

邯郸学步

滥竽充数

掩耳盗铃

龟兔赛跑

狼来了

狐假虎威

农夫与狼

捕蝉翁

这些故事通过动物的形象和情节，传达了各种深刻的道理和教训，对三年级学生具有很好的教育意义。