《伯牙善鼓琴》的故事最早出自《列子》，后来也收入了《吕氏春秋》中，具体如下：

《列子》版本

《伯牙善鼓琴》选自《列子》，为战国郑国人列御寇所著。

《列子》中记载了琴师伯牙与樵夫钟子期之间由于鼓琴听琴而产生的交情。

《吕氏春秋》版本

《伯牙善鼓琴》也选自《吕氏春秋》第十四卷《孝行览･本味》。

《吕氏春秋》中同样讲述了伯牙与钟子期的故事，并强调了知音的重要性。

因此，《伯牙善鼓琴》的故事主要选自《列子》，但也有部分内容为《吕氏春秋》所收录。